More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1289 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  51.66 
 
 
755 aa  741    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  54.31 
 
 
752 aa  794    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  55 
 
 
752 aa  803    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  46.98 
 
 
762 aa  706    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  49.42 
 
 
770 aa  771    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  54.44 
 
 
752 aa  794    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
758 aa  1574    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  40.58 
 
 
829 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  40.58 
 
 
831 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  40.58 
 
 
829 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  40.7 
 
 
829 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  39.71 
 
 
828 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  39.71 
 
 
828 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  40.08 
 
 
829 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  40.08 
 
 
829 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  39.6 
 
 
828 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  39.6 
 
 
828 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  39.83 
 
 
828 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.556235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  39.6 
 
 
828 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  40.2 
 
 
829 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  39.83 
 
 
828 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  39.83 
 
 
828 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  39.6 
 
 
828 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  40.08 
 
 
829 aa  618  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  39.83 
 
 
828 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  39.48 
 
 
828 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  39.48 
 
 
828 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  38.53 
 
 
828 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  39.47 
 
 
834 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  38.41 
 
 
828 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  37.8 
 
 
831 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  39.48 
 
 
828 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  39.09 
 
 
834 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  39.48 
 
 
828 aa  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  39.34 
 
 
831 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  38.5 
 
 
837 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  38.53 
 
 
828 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  38.41 
 
 
831 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  39.12 
 
 
829 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2791  nitrate reductase catalytic subunit  38.64 
 
 
830 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0978398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1387  nitrate reductase catalytic subunit  38.64 
 
 
830 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  38.79 
 
 
827 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1273  nitrate reductase catalytic subunit  38.64 
 
 
830 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  39.57 
 
 
827 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  38.87 
 
 
834 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  37.96 
 
 
831 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  39.33 
 
 
827 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  39.04 
 
 
837 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  37.41 
 
 
827 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  38.08 
 
 
831 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  37.74 
 
 
829 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  39.09 
 
 
826 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4009  nitrate reductase catalytic subunit  38.99 
 
 
848 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  38.52 
 
 
831 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  39.43 
 
 
834 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  38.08 
 
 
831 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  38.36 
 
 
831 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  38.72 
 
 
835 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  39.45 
 
 
832 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  38.74 
 
 
826 aa  592  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  37.54 
 
 
838 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  37.72 
 
 
838 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  38.97 
 
 
831 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  37.99 
 
 
829 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0704  nitrate reductase catalytic subunit  39.09 
 
 
826 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3318  nitrate reductase catalytic subunit  39.09 
 
 
826 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  38.08 
 
 
829 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0553  nitrate reductase catalytic subunit  38.74 
 
 
827 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  39.21 
 
 
831 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  38.27 
 
 
831 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  38.72 
 
 
829 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  38.29 
 
 
834 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  38.97 
 
 
826 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  38.79 
 
 
831 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3430  nitrate reductase catalytic subunit  38.97 
 
 
826 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0847  nitrate reductase catalytic subunit  39.09 
 
 
831 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.22751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  37.31 
 
 
828 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  37.73 
 
 
839 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  37.9 
 
 
829 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  37.69 
 
 
851 aa  585  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3511  nitrate reductase catalytic subunit  38.86 
 
 
831 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  38.98 
 
 
837 aa  584  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  38.86 
 
 
826 aa  582  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  38.26 
 
 
826 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  37.37 
 
 
829 aa  568  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4721  nitrate reductase catalytic subunit  37.91 
 
 
831 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.068762  normal  0.0333447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.17 
 
 
851 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  35.9 
 
 
854 aa  531  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  41.05 
 
 
1396 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 
744 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  40.65 
 
 
931 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  40.78 
 
 
1180 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  41.45 
 
 
1171 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.51 
 
 
1383 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  39.61 
 
 
1395 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  39.61 
 
 
1395 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  39.97 
 
 
946 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  40.36 
 
 
1403 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  39.42 
 
 
1397 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.06 
 
 
1395 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>