68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1235 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  100 
 
 
276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  68.91 
 
 
276 aa  391  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.91 
 
 
269 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.54 
 
 
271 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.8 
 
 
264 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.3 
 
 
264 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.04 
 
 
263 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.21 
 
 
264 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.93 
 
 
264 aa  367  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.66 
 
 
279 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.79 
 
 
292 aa  363  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.15 
 
 
264 aa  362  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.1 
 
 
264 aa  361  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.1 
 
 
264 aa  361  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.1 
 
 
264 aa  361  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.45 
 
 
264 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.87 
 
 
264 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.41 
 
 
276 aa  359  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.62 
 
 
264 aa  357  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  62.36 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.14 
 
 
264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.99 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.99 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.99 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.99 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.99 
 
 
264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.27 
 
 
264 aa  355  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  62.59 
 
 
264 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.89 
 
 
264 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.91 
 
 
264 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.59 
 
 
264 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  61.62 
 
 
264 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.69 
 
 
273 aa  351  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.89 
 
 
264 aa  347  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.36 
 
 
271 aa  317  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.36 
 
 
271 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  56.34 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  42.16 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.64 
 
 
125 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  36.36 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1144  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.32 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  22.73 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.44 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3746  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  34.15 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1664  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.13 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.02 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20181  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.32 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.44 
 
 
123 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 
129 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17591  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  21.85 
 
 
144 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.44 
 
 
123 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2192  S-adenosylmethionine decarboxylase related  40.62 
 
 
154 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17791  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.79 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.899684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0582  S-adenosylmethionine decarboxylase related  37.5 
 
 
171 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17631  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.88 
 
 
144 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0734  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  33.77 
 
 
133 aa  42.7  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.205872  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0617  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.57 
 
 
125 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal  0.723044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.37 
 
 
124 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0747  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  32.47 
 
 
133 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.77 
 
 
123 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>