More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1137 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  100 
 
 
468 aa  944    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50.44 
 
 
482 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.78 
 
 
476 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  37.31 
 
 
475 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.18 
 
 
452 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  32.74 
 
 
445 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  38.72 
 
 
446 aa  226  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  35.89 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  33.55 
 
 
448 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  30.8 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  30.26 
 
 
582 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  49.65 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  49.65 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.03 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.4 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  43.79 
 
 
375 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  48.95 
 
 
456 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  48.78 
 
 
301 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  31.84 
 
 
419 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.97 
 
 
402 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  50.82 
 
 
375 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  49.59 
 
 
375 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  49.59 
 
 
231 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  45.65 
 
 
387 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  47.73 
 
 
441 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.24 
 
 
313 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  51.18 
 
 
230 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.58 
 
 
430 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  46.28 
 
 
300 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  47.5 
 
 
450 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.85 
 
 
283 aa  123  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  48.74 
 
 
318 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  32.26 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  46.85 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  47.79 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50.86 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.33 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  48.03 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  49.57 
 
 
431 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  40 
 
 
379 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  44.54 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  35.26 
 
 
377 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  48.72 
 
 
377 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.8 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  36.23 
 
 
340 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  47.41 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  49.57 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  49.18 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.72 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.56 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.24 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.93 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  49.58 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  46.15 
 
 
455 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  41.82 
 
 
328 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.14 
 
 
443 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.67 
 
 
309 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.58 
 
 
590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  51.82 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  44.44 
 
 
296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.61 
 
 
288 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  39.88 
 
 
404 aa  117  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  48.28 
 
 
469 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.69 
 
 
314 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  43.55 
 
 
293 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.15 
 
 
372 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  47.9 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.8 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.08 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.67 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  44.88 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  45.53 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  52.29 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  28.53 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  49.11 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  43.57 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  43.57 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  49.57 
 
 
305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.9 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  50.43 
 
 
751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  50.96 
 
 
392 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.06 
 
 
454 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  50.42 
 
 
414 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  47.93 
 
 
297 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  44.09 
 
 
313 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  48.28 
 
 
402 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.8 
 
 
324 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  50.96 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.72 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  43.9 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  56.25 
 
 
541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  50 
 
 
392 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  44.63 
 
 
332 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.86 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  47.41 
 
 
330 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  43.9 
 
 
310 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  47.62 
 
 
417 aa  113  9e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  38.99 
 
 
290 aa  113  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  45.04 
 
 
238 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  54 
 
 
332 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>