More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1038 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
382 aa  778  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.8217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  54.91 
 
 
380 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  53.95 
 
 
385 aa  415  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  53.35 
 
 
381 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.09414e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  52.51 
 
 
382 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  51.46 
 
 
388 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  50.4 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  50 
 
 
380 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  49.87 
 
 
400 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  49.08 
 
 
381 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  54.97 
 
 
383 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  46.56 
 
 
381 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  49.07 
 
 
384 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  48.66 
 
 
380 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  49.09 
 
 
385 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.42055e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  49.46 
 
 
380 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  47.72 
 
 
383 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  46.97 
 
 
378 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  47.87 
 
 
383 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  46.68 
 
 
379 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  46.79 
 
 
381 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.58193e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  45.7 
 
 
385 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  47.34 
 
 
381 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  43.31 
 
 
398 aa  338  1e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  44.76 
 
 
386 aa  335  6e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  44.5 
 
 
386 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  44.95 
 
 
381 aa  321  1e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  43.62 
 
 
380 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  41.16 
 
 
381 aa  312  5e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  42.51 
 
 
380 aa  295  8e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  42.52 
 
 
390 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  38.56 
 
 
392 aa  287  3e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  42.97 
 
 
388 aa  282  7e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  44.3 
 
 
387 aa  282  9e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  42.06 
 
 
413 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  41.85 
 
 
379 aa  279  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  40.05 
 
 
382 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  39.26 
 
 
380 aa  264  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  38.32 
 
 
388 aa  263  5e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  35.28 
 
 
378 aa  254  1e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  38.8 
 
 
376 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  39.21 
 
 
879 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  38.9 
 
 
383 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  37.04 
 
 
386 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  36.58 
 
 
392 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  36.94 
 
 
393 aa  234  2e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.17 
 
 
393 aa  222  1e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.2 
 
 
412 aa  220  4e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
376 aa  212  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.44 
 
 
878 aa  212  8e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  35.42 
 
 
393 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  36.12 
 
 
880 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  34.57 
 
 
394 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.77 
 
 
406 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.77 
 
 
406 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33 
 
 
435 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  35.34 
 
 
896 aa  202  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.94 
 
 
419 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.68 
 
 
419 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.86 
 
 
394 aa  201  2e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  34.44 
 
 
425 aa  198  1e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.55 
 
 
885 aa  198  1e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.42 
 
 
441 aa  197  2e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.71182e-10 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.7 
 
 
408 aa  196  8e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 
420 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.38 
 
 
644 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  33.86 
 
 
403 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.11 
 
 
419 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  2.01738e-08 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 
412 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.39 
 
 
409 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  33.33 
 
 
420 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  34.1 
 
 
420 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.65 
 
 
433 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.36 
 
 
608 aa  190  3e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 
404 aa  191  3e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.59 
 
 
406 aa  191  3e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.1207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.59 
 
 
406 aa  190  3e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  33.25 
 
 
423 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.46 
 
 
410 aa  190  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.59 
 
 
406 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.85 
 
 
415 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.51 
 
 
406 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  2.89207e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.16 
 
 
673 aa  189  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 
413 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.9 
 
 
414 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.11 
 
 
406 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.58 
 
 
443 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  32.99 
 
 
626 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  33.16 
 
 
688 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  33.15 
 
 
395 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.74 
 
 
406 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  33.07 
 
 
410 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  32.37 
 
 
405 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.81 
 
 
418 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.74 
 
 
406 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.81 
 
 
418 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.74 
 
 
406 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.74 
 
 
406 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.02 
 
 
417 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 
413 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>