More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1031 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
323 aa  669  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  71.12 
 
 
322 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  44.13 
 
 
328 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  40.3 
 
 
325 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  40.06 
 
 
324 aa  243  2e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 
323 aa  238  7e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 
350 aa  213  3e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
328 aa  165  1e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
862 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
339 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
310 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.23 
 
 
352 aa  148  1e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 
332 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
354 aa  134  1e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  27.27 
 
 
348 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 
327 aa  134  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.65 
 
 
354 aa  134  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
324 aa  130  2e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
337 aa  127  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.53 
 
 
346 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
329 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
331 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 
366 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.25 
 
 
335 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
324 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
368 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 
329 aa  117  2e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
322 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 
320 aa  116  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28.98 
 
 
348 aa  115  7e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 
321 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
314 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 
321 aa  112  1e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
353 aa  111  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
324 aa  110  4e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 
334 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  30.63 
 
 
354 aa  109  7e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
354 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  29.36 
 
 
354 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  24.85 
 
 
363 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
340 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  28.31 
 
 
359 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  25.71 
 
 
334 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
344 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
334 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  26.04 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
359 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  25.53 
 
 
357 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  27.24 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  27.52 
 
 
354 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
371 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  26.44 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 
383 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
359 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  26.48 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  25.07 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 
400 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
345 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 
361 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  27.1 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  25.99 
 
 
341 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
352 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 
363 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  26.51 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  27.39 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
356 aa  85.5  1e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  26.89 
 
 
359 aa  85.9  1e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  25.77 
 
 
342 aa  85.5  1e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
326 aa  85.5  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
344 aa  85.5  1e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  26.89 
 
 
359 aa  85.9  1e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
358 aa  85.5  1e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
384 aa  84.3  2e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  26.89 
 
 
359 aa  84.7  2e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
359 aa  84.3  2e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  28.12 
 
 
366 aa  83.6  4e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
365 aa  83.6  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  24.53 
 
 
349 aa  83.6  4e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  23.46 
 
 
365 aa  82.8  7e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 
359 aa  82.8  7e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  24.2 
 
 
394 aa  82.4  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  26.43 
 
 
349 aa  82  1e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.2 
 
 
358 aa  81.6  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 
324 aa  81.3  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>