More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1006 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  100 
 
 
503 aa  1015    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.1 
 
 
480 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
515 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.72 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
509 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
504 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
524 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
471 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  40.29 
 
 
477 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
490 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  38.58 
 
 
490 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
522 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.93 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
532 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
532 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
517 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  37.76 
 
 
477 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  38.89 
 
 
520 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
504 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
473 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
500 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
474 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
601 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35.13 
 
 
486 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.82 
 
 
486 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  39.13 
 
 
487 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
470 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
474 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
473 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
473 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
473 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
452 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
524 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  39.23 
 
 
485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  31.09 
 
 
487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  36.42 
 
 
471 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
484 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
484 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  30.15 
 
 
481 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  39.86 
 
 
488 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
528 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
503 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  34.01 
 
 
559 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3266  histidine kinase  33.73 
 
 
476 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  28.69 
 
 
471 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
365 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
455 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
469 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.83 
 
 
471 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
463 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  41.26 
 
 
473 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  35.17 
 
 
484 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
502 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  33.43 
 
 
470 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
484 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  37.97 
 
 
483 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
585 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  35.69 
 
 
477 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
534 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
535 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
529 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
487 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
484 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
509 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
487 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  35.29 
 
 
484 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  28.46 
 
 
472 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
484 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  35.07 
 
 
479 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
484 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.79 
 
 
496 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
484 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  176  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.03 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.86 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.32 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
546 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  34.95 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  31.44 
 
 
463 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
462 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.86 
 
 
463 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
582 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  37.81 
 
 
357 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
469 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>