121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0990 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 173 aa  361  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1536  NUDIX hydrolase  59.01 
 
 		 331 aa  214  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl471  nucleoside diphosphate (nudix) hydrolase  43.86 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00345431  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1742  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.445003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0674  NUDIX family hydrolase  32.41 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  41.86 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1593  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17300  ADP-ribose pyrophosphatase  31.55 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  33.79 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1120  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1548  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.86 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2914  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.65 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1205  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  37.93 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  29.71 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0269  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  29.66 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 283 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0674  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.1 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3270  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.2 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3207  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.2 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3195  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.2 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.376007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3375  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.2 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0625  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  43.64 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3117  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.129541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2049  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00026256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  30.51 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  41.82 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13638  putative isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.7 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.279506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2826  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3273  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.32 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3389  NUDIX hydrolase  22.58 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0803  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  23.74 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 229 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0193  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  32.53 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3215  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.74 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4179  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.74 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3045  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.85 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  31.82 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.82849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2543  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  24.69 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1623  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  39.39 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26905  predicted protein  29.67 
 
 		 216 aa  47.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0375733  normal  0.0729725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  29.08 
 
 		 503 aa  47.8  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.08 
 
 		 503 aa  47.8  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0820  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.74 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02721  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.47 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3022  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.74 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02684  hypothetical protein  32.47 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3308  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.47 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2237  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0632516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1781  MutT/Nudix family protein  32.43 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4438  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.76 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9366  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  25.93 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.189435  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2070  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000173279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2276  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.41 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04480  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.81 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4299  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  33.77 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.651923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 273 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07000  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0725  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1823  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00460593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1798  MutT/Nudix family protein  31.53 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1964  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000761489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1408  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.797387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0419  Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase  28.57 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3359  mutT/nudix family protein  34.07 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.039473  hitchhiker  0.00000000000000713164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2000  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.7905499999999994e-43 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2032  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  34.67 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4731  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  30.69 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291133  decreased coverage  0.0000344266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2848  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000562976  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3048  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  23.02 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3318  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000044442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4928  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.59 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.255355 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7007  predicted protein  38.67 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  39.66 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  36.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>