More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0947 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  100 
 
 		 505 aa  1040    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  79.6 
 
 		 494 aa  853    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  60.83 
 
 		 490 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  58.89 
 
 		 491 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.51 
 
 		 494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.85 
 
 		 506 aa  597  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  58.02 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  57.71 
 
 		 491 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  57.92 
 
 		 495 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.22 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  57.43 
 
 		 492 aa  588  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  57.51 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  56.63 
 
 		 493 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  57.23 
 
 		 496 aa  586  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  56.32 
 
 		 491 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.42 
 
 		 493 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.61 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  56.92 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.71 
 
 		 495 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  57.34 
 
 		 491 aa  568  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.51 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  59.4 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.51 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.65 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  51.98 
 
 		 580 aa  522  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  50.89 
 
 		 2126 aa  507  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  47.54 
 
 		 2126 aa  485  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  48.22 
 
 		 2135 aa  482  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.12 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  49.51 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  47.75 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  47.75 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  47.23 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  48.13 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  47.75 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.04 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.81 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.11 
 
 		 491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  47.23 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.92 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.11 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  46.85 
 
 		 489 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.2 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  47.22 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  45.35 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  46.92 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  46.55 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  44.86 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.21 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  45.12 
 
 		 488 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  46.45 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  45.4 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  44.91 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  47.42 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  45.06 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  45.45 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.62 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  44.31 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  46.64 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.06 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  44.71 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  46.46 
 
 		 487 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  44.66 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  44.66 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  44.89 
 
 		 488 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  46.64 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  44.88 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  45.61 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.86 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  44.64 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  44.81 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  44.38 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  44.89 
 
 		 488 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  44.16 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  44.64 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  44.14 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.26 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  43.33 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  46.83 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  44.38 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  44.44 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  44.14 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  45.96 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  45.96 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  46.83 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  45.28 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  45.08 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  46.06 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  45.68 
 
 		 505 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  47.34 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  45.87 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  44.02 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  43.82 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  43.4 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  45.3 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  45.11 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  45.3 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  43.82 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>