More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0870 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  34.75 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.17 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.99 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.8 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.82 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.48 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.3 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.87 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.65 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.88 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.79 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.04 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.65 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.55 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.46 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  36.36 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  31.62 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.62 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  33.57 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  34.51 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.62 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.62 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.51 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.76 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.12 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.87 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.76 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  30.88 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  29.5 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.35 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.93 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.88 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.88 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  30.5 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.66 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.88 
 
 		 288 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  32.14 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  27.81 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.47 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  30.07 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.04 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.58 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.86 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.22 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.03 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.16 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.66 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.79 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.78 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.16 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  30.26 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.43 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>