64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0867 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  30.08 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  34.86 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.69 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  34.86 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  32.06 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.92 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  36.96 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  36.96 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  27.87 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  34.68 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  37.93 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  30.6 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  36.05 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  29.03 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  33.73 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  34.15 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  39.53 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  29 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  25.36 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  35.9 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  35.48 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  35.21 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  22.39 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  24.3 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  32.93 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  29.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  36.21 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  29.47 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  31.08 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  37.93 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  35.48 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  27.03 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  46.81 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  30.59 
 
 
108 aa  43.9  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  30.67 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  30.67 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  29.33 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  40.43 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  31.15 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  40.43 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  30.65 
 
 
124 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  39.13 
 
 
191 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  34.48 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  41.3 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  35.59 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  41.03 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  36.47 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>