More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0860 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  84.86 
 
 
406 aa  671    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
403 aa  818    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  61.79 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  45.05 
 
 
409 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.02 
 
 
407 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.41 
 
 
394 aa  300  3e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
396 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
315 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  44.77 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  44.95 
 
 
318 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  43.97 
 
 
318 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  42.9 
 
 
323 aa  265  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  47.47 
 
 
556 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  43.32 
 
 
318 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
321 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.81 
 
 
321 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  42.81 
 
 
321 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  43.04 
 
 
308 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
318 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
318 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  42.81 
 
 
318 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  42.81 
 
 
318 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  42.16 
 
 
318 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
304 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  41.83 
 
 
318 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.94 
 
 
326 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.44 
 
 
310 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  44.81 
 
 
312 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  42.39 
 
 
334 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  45.05 
 
 
555 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  42.44 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
312 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  42.52 
 
 
317 aa  252  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
310 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  44.3 
 
 
321 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  44.23 
 
 
327 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
320 aa  249  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.86 
 
 
317 aa  249  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  42.02 
 
 
310 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  43.18 
 
 
309 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
311 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  42.16 
 
 
311 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  42.07 
 
 
310 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.57 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.29 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  41.21 
 
 
547 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  42.41 
 
 
638 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
304 aa  242  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.97 
 
 
555 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  41.1 
 
 
318 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  41.56 
 
 
309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
332 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  41.16 
 
 
319 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.94 
 
 
335 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
311 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  40.06 
 
 
340 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
317 aa  237  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.45 
 
 
331 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  39.34 
 
 
306 aa  236  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  40.66 
 
 
306 aa  235  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  45.62 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  39.81 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  41.88 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  40 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  40.45 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  40.98 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  42.77 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.13 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  48.57 
 
 
306 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  41.64 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  40.78 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  38.78 
 
 
310 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  40.07 
 
 
306 aa  233  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  41.1 
 
 
348 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  42.67 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  41.78 
 
 
308 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
333 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  39.41 
 
 
340 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  43.09 
 
 
325 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  40.13 
 
 
332 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  41.83 
 
 
316 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
335 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
308 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.8 
 
 
306 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
312 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  39.29 
 
 
317 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  37.22 
 
 
359 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  40.69 
 
 
317 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.66 
 
 
302 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
313 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  40.91 
 
 
348 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  38.16 
 
 
346 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
331 aa  227  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.81 
 
 
330 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  41.23 
 
 
320 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  40.58 
 
 
552 aa  226  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  42.02 
 
 
325 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  39.02 
 
 
333 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
306 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>