183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0787 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  100 
 
 		 600 aa  1221    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  58.04 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  42.42 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  39.3 
 
 		 1452 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.64 
 
 		 1550 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  43.68 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.89 
 
 		 2884 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  52.45 
 
 		 435 aa  160  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  53.85 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  49.15 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  55.94 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  51.05 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  52.08 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  48.95 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  44.06 
 
 		 458 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  48.59 
 
 		 481 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  51.05 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.05 
 
 		 706 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  30.79 
 
 		 637 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.32 
 
 		 649 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.93 
 
 		 795 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  48.87 
 
 		 569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.95 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  44.06 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  44.06 
 
 		 303 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 303 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  48.37 
 
 		 403 aa  130  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  29.05 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  44.76 
 
 		 439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  46.46 
 
 		 305 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  39.16 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 619 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  39.16 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  44.37 
 
 		 304 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.35 
 
 		 769 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  45.22 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  42.66 
 
 		 520 aa  124  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  42.86 
 
 		 591 aa  124  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.55 
 
 		 326 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  44.14 
 
 		 296 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.34 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  43.36 
 
 		 580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  36.62 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  46.27 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  37.37 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  37.37 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  42.66 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  39.22 
 
 		 314 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  37.37 
 
 		 604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  43.66 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  41.67 
 
 		 781 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  42.55 
 
 		 253 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  45.31 
 
 		 219 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  29.36 
 
 		 589 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  39.86 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  29.75 
 
 		 962 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.51 
 
 		 871 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  31.21 
 
 		 688 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.15 
 
 		 1045 aa  110  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  38.62 
 
 		 579 aa  110  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  40.62 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  39.86 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  40.48 
 
 		 337 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  39.44 
 
 		 368 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  45.38 
 
 		 686 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  37.93 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  38.89 
 
 		 608 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.3 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  36.84 
 
 		 319 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  41.91 
 
 		 248 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  37.24 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.06 
 
 		 1412 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.83 
 
 		 749 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  42.06 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  42.02 
 
 		 420 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  27.97 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  42.4 
 
 		 582 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  41.18 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  36.08 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  28.71 
 
 		 1916 aa  100  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  41.91 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.45 
 
 		 1312 aa  98.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  41.88 
 
 		 642 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  38.19 
 
 		 772 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  35.66 
 
 		 776 aa  98.2  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>