32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0774 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0774  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 171 aa  358  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  21.67 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 207 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  20.9 
 
 		 207 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 182 aa  44.3  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  28.87 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 188 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  20.24 
 
 		 194 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  22.62 
 
 		 205 aa  40.8  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 222 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 212 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>