178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0741 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  100 
 
 
143 aa  286  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  59.57 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  50.7 
 
 
143 aa  146  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  49.3 
 
 
143 aa  144  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  48.63 
 
 
145 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  48.57 
 
 
138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  48.57 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  44.29 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  43.26 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.32 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  40.71 
 
 
141 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  40.71 
 
 
141 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  46.43 
 
 
138 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.55 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.57 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.99 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  29.08 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  29.08 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  29.08 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  28.37 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  28.37 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  28.37 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  27.4 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  28.37 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  28.37 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  28.37 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  31.03 
 
 
404 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  32.88 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
400 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
396 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  26.39 
 
 
403 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25 
 
 
392 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  32.19 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  26.95 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.45 
 
 
396 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  32.19 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  28.85 
 
 
402 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.52 
 
 
405 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  32.19 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
395 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3191  flavodoxin  30.41 
 
 
409 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0415851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
395 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  26.17 
 
 
387 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
387 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  32.64 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
421 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00451  flavoprotein  28.67 
 
 
600 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  30.41 
 
 
431 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 
387 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.61 
 
 
396 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1375  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  27.48 
 
 
616 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0043  flavoprotein  27.97 
 
 
593 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
387 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  25.52 
 
 
575 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  29.05 
 
 
399 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00431  flavoprotein  28.67 
 
 
600 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.175879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  24.16 
 
 
387 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  30.15 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1810  flavoprotein  25.34 
 
 
584 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.361891  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00561  flavoprotein  27.48 
 
 
500 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  26.92 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 
571 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 
571 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
402 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  25.52 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.07 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
576 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  24.49 
 
 
401 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.49 
 
 
401 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  24 
 
 
399 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00491  flavoprotein  26.76 
 
 
600 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
397 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.83 
 
 
878 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 
425 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  27.27 
 
 
404 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  31.3 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.83 
 
 
878 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
405 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 
396 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  23.33 
 
 
399 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  40.35 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.87 
 
 
404 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  30.53 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.67 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  24.66 
 
 
574 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.67 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
402 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  52.17 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  26 
 
 
500 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  25.17 
 
 
613 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.34 
 
 
573 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  24.49 
 
 
418 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36317  predicted protein  28.47 
 
 
588 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>