73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0648 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  100 
 
 		 340 aa  697    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  38.82 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  39.82 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  32.38 
 
 		 355 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  33.24 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  35.5 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  31.02 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  30.03 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  29.82 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  28.71 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  28.02 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  26.25 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  27.16 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.03 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  30.77 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  26.17 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  36.51 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  40.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.57 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  43.9 
 
 		 533 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  21.29 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  23.86 
 
 		 497 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  31.4 
 
 		 555 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  24.48 
 
 		 416 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.81 
 
 		 565 aa  46.2  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.46 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  51.52 
 
 		 595 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  43.48 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  38.3 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  36.67 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  45.83 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  32.79 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.46 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  41.46 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 601 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  41.18 
 
 		 520 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  42.55 
 
 		 891 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 565 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  43.9 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.14 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  28.81 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.26 
 
 		 976 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  37.04 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.84 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  43.48 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  40.74 
 
 		 582 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  27.78 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 599 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  32.14 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 812 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  43.9 
 
 		 537 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.54 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  25.9 
 
 		 712 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  25.17 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  28.57 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  39.47 
 
 		 560 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 557 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  30.21 
 
 		 241 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  48.65 
 
 		 575 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>