57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0643 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
374 aa  764    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  46.31 
 
 
399 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  40.44 
 
 
354 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  37.01 
 
 
370 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  37.01 
 
 
370 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  30.06 
 
 
371 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  33.24 
 
 
375 aa  169  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.71 
 
 
349 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.75 
 
 
386 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  28.39 
 
 
375 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  30.68 
 
 
368 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  31.25 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  30.68 
 
 
353 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  28.41 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  28.41 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.57 
 
 
399 aa  116  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.61 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  29.02 
 
 
394 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  29.6 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  31.31 
 
 
365 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28.45 
 
 
367 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.94 
 
 
396 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  26.53 
 
 
345 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  27.9 
 
 
406 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.2 
 
 
391 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  27.09 
 
 
470 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  30 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  26.4 
 
 
539 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  28.78 
 
 
458 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  25.57 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.82 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  24.86 
 
 
617 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  24.84 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  26.09 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  24.4 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  30.7 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  26.15 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  25.49 
 
 
650 aa  86.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  26.91 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  23.64 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  24.86 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  25.79 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  26.69 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  28.03 
 
 
638 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  25.51 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  29.89 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  23.85 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  33.04 
 
 
159 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
589 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  30.91 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  27.17 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  25.13 
 
 
320 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  25.77 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  26.53 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  24.31 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  25.64 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>