28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0627 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  357  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  49.43 
 
 
482 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  50.57 
 
 
412 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  48.3 
 
 
482 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  48.3 
 
 
488 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  47.73 
 
 
481 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  47.16 
 
 
482 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  48.3 
 
 
481 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  47.16 
 
 
480 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  46.02 
 
 
483 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  47.73 
 
 
484 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  48.28 
 
 
510 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  48.86 
 
 
484 aa  157  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  45.98 
 
 
486 aa  157  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  44.89 
 
 
494 aa  151  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  43.75 
 
 
510 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  44.89 
 
 
478 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  44.25 
 
 
489 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  30.99 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  30.6 
 
 
487 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  33.58 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  32.06 
 
 
490 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  27.32 
 
 
488 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  27.27 
 
 
515 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 
487 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  32.67 
 
 
538 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  33.33 
 
 
450 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  24.54 
 
 
492 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>