71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0530 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  788    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  27.27 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.17 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.69 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.47 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.44 
 
 		 485 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.65 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.65 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.65 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.65 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  25.19 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  32.65 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  32.65 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  25.44 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  24.08 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.19 
 
 		 458 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 573 aa  49.7  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  28 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 452 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.04 
 
 		 489 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 521 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1525  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  24.75 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.3 
 
 		 536 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 573 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  30.71 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 553 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.17 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 565 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>