More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0469 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  100 
 
 		 386 aa  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  42.64 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.78 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.59 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  32.23 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.1 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40 
 
 		 481 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.16 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.81 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.81 
 
 		 464 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  39.77 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.78 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.78 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.78 
 
 		 464 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  38.78 
 
 		 464 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  34.51 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  39 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.64 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.48 
 
 		 461 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  35.5 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.4 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.55 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.55 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  36.4 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  36.5 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.84 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  36.4 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.5 
 
 		 476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  36.56 
 
 		 418 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  34.87 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 		 484 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 		 484 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  37.55 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.25 
 
 		 492 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  33.62 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.15 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  36.36 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  34.36 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.51 
 
 		 471 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  34.11 
 
 		 403 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  34.7 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  29.43 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  36.06 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.59 
 
 		 445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  33.46 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  34.1 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  35.02 
 
 		 391 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  32.95 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  35.23 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.07 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  33.46 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  35.27 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  32.82 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  35.27 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  35.27 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  35.27 
 
 		 391 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  33.72 
 
 		 453 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  33.72 
 
 		 453 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  34.85 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  34.09 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  34.71 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  32.13 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  35.45 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  34.71 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 424 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  30.68 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  34.39 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  33.83 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  33.08 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  32.58 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  31.18 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  31.25 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  31.25 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  33.47 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  32.58 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  32.63 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  31.5 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  31.8 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  32.58 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  32.58 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.95 
 
 		 452 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  33.59 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  30.48 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  32.58 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>