More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0441 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
147 aa  288  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
147 aa  204  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  63.01 
 
 
147 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  67.12 
 
 
146 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 
146 aa  180  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  176  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 
146 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  62.59 
 
 
146 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  174  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
147 aa  174  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  63.7 
 
 
146 aa  173  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  57.24 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  63.7 
 
 
146 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  60.96 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  59.59 
 
 
146 aa  169  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  65.31 
 
 
147 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  61.9 
 
 
149 aa  166  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
147 aa  165  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  57.93 
 
 
146 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
147 aa  165  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 
148 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
146 aa  163  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  55.86 
 
 
149 aa  163  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  62.59 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  56.55 
 
 
147 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  58.22 
 
 
148 aa  157  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  58.39 
 
 
148 aa  156  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  60 
 
 
148 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  57.82 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  60.54 
 
 
147 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 
145 aa  150  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  59.59 
 
 
172 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  147  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  59.18 
 
 
147 aa  147  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  54.42 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  52.38 
 
 
152 aa  144  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
144 aa  144  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  54.48 
 
 
157 aa  144  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 
145 aa  144  5e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  63.7 
 
 
149 aa  144  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
147 aa  143  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
148 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 
149 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  49.01 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  50 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  55.07 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  53.47 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  54.3 
 
 
153 aa  137  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 
153 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  53.79 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  53.06 
 
 
148 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
156 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  49.67 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
156 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  56.46 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 
153 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  48 
 
 
159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  48.28 
 
 
176 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 
167 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  52.41 
 
 
144 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 
144 aa  129  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 
144 aa  130  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  51.37 
 
 
153 aa  129  9e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  52.32 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0215  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000332243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3740  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4037  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000806157  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4151  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000273601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  50.34 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>