More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0437 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 178 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  67.25 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  66.08 
 
 		 182 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  64.8 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  64.71 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  65.12 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  61.2 
 
 		 181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  58.19 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  61.02 
 
 		 178 aa  210  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  61.05 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  60 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 180 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.5 
 
 		 180 aa  197  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.93 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  57.78 
 
 		 180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  54.8 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  58.29 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  55 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 182 aa  190  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  54.35 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 181 aa  187  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  54.97 
 
 		 182 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  55.08 
 
 		 187 aa  184  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>