More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0425 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  75.72 
 
 		 275 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  76.09 
 
 		 275 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  74.18 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  71.9 
 
 		 275 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  71.74 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  73.36 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  73.19 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  72.99 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  71.01 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  72.16 
 
 		 273 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  69.71 
 
 		 275 aa  407  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  71.12 
 
 		 277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  70.29 
 
 		 276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  70.65 
 
 		 276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  70.29 
 
 		 276 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  71.12 
 
 		 277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  71.12 
 
 		 277 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  69.93 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  69.68 
 
 		 277 aa  401  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  68.59 
 
 		 277 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  69.57 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  70.76 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  70.76 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  68.84 
 
 		 277 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  69.68 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  70.91 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  70 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  71.48 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  69.2 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  68.86 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  69.2 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  68.48 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  69.09 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  65.7 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  64.26 
 
 		 280 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  65.7 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  64.23 
 
 		 283 aa  374  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  65.09 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  65.69 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  64.75 
 
 		 278 aa  364  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  66.79 
 
 		 281 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  68.08 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  66.91 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 277 aa  358  4e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 274 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  64.44 
 
 		 279 aa  357  9e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0373  50S ribosomal protein L2  60.14 
 
 		 287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  62.86 
 
 		 281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3009  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.141186  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  65.34 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  61.62 
 
 		 287 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  61.82 
 
 		 274 aa  352  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1126  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20001  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 287 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.738026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23051  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  61.25 
 
 		 287 aa  352  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 274 aa  351  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  63.44 
 
 		 279 aa  351  8.999999999999999e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  61.21 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 278 aa  349  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1958  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 287 aa  348  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  64.86 
 
 		 276 aa  347  9e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 		 275 aa  346  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5127  ribosomal protein L2  65.31 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.840283 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16751  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  60.37 
 
 		 287 aa  344  8e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  344  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3902  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  63.18 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17461  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1647  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  62.72 
 
 		 280 aa  342  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 277 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 281 aa  341  7e-93  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>