More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0417 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  80.43 
 
 
137 aa  222  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  78.42 
 
 
142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  75.71 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  75.71 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  75.71 
 
 
140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  74.29 
 
 
140 aa  208  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  75.36 
 
 
145 aa  207  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  76.09 
 
 
124 aa  205  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  75.36 
 
 
124 aa  205  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  76.09 
 
 
124 aa  205  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  76.64 
 
 
142 aa  203  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  73.91 
 
 
125 aa  203  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  75.91 
 
 
123 aa  203  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
137 aa  202  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  72.14 
 
 
135 aa  201  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  75.18 
 
 
123 aa  201  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  73.19 
 
 
137 aa  202  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
123 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
137 aa  201  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
137 aa  201  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  74.64 
 
 
124 aa  201  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
123 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  75 
 
 
140 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
123 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  72.66 
 
 
135 aa  200  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
139 aa  199  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 
151 aa  199  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 
146 aa  199  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
137 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  74.45 
 
 
123 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
123 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  72.46 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
123 aa  198  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  72.99 
 
 
123 aa  197  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
137 aa  197  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 
123 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  70.99 
 
 
144 aa  196  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  70.99 
 
 
144 aa  196  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
123 aa  196  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
137 aa  196  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  72.26 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  70 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  70.23 
 
 
144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 
123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  195  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  195  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  70.5 
 
 
135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  73.19 
 
 
125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  69.78 
 
 
125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  69.78 
 
 
125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  70.29 
 
 
137 aa  194  5.000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  70.8 
 
 
128 aa  194  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  71.01 
 
 
125 aa  194  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  73.19 
 
 
125 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  70.5 
 
 
136 aa  193  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
126 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 
124 aa  193  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
126 aa  193  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 
125 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  71.94 
 
 
128 aa  193  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  71.11 
 
 
135 aa  193  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  71.94 
 
 
126 aa  192  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
123 aa  192  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 
135 aa  192  9e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
127 aa  192  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  69.06 
 
 
128 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  71.94 
 
 
125 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
129 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  68.35 
 
 
136 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  70.71 
 
 
126 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
124 aa  192  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
123 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 
123 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  71.22 
 
 
125 aa  191  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  70.07 
 
 
123 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  70 
 
 
126 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  71.22 
 
 
125 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  71.94 
 
 
125 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
123 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 
123 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>