36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0416 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  100 
 
 
83 aa  165  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  48.19 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  48.81 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  49.38 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  50.65 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  51.28 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  44.87 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  52.94 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  46.91 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.31 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.87 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.36 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.89 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.74 
 
 
82 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  41.18 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  36.76 
 
 
84 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  36.76 
 
 
84 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  34.15 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  34.15 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  39.71 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1190  ribosomal protein L7AE family protein  33.33 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000936899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  31.71 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  29.27 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  29.27 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  29.27 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  29.27 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  29.27 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  33.73 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.88 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>