More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0405 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  77.01 
 
 		 175 aa  280  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  74.29 
 
 		 175 aa  255  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  71.84 
 
 		 175 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  66.86 
 
 		 175 aa  246  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  64.94 
 
 		 174 aa  243  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  63.28 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  63.28 
 
 		 178 aa  240  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  64.41 
 
 		 177 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  60.57 
 
 		 203 aa  235  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  64.33 
 
 		 188 aa  231  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  63.37 
 
 		 187 aa  230  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  61.63 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  62.5 
 
 		 182 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  62.5 
 
 		 182 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  61.05 
 
 		 194 aa  223  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  63.07 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  64.12 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  64.71 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  66.67 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  59.3 
 
 		 176 aa  219  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  65.54 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  58.14 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  64.97 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  57.56 
 
 		 177 aa  210  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  58.14 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  56.73 
 
 		 201 aa  202  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  54.1 
 
 		 306 aa  200  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  54.24 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  56.73 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  56.73 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  52.2 
 
 		 273 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  54.34 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  53.37 
 
 		 266 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  51.63 
 
 		 266 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  53.11 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  54.29 
 
 		 181 aa  193  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 		 277 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  55.11 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  53.3 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  50.85 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  50 
 
 		 272 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  51.14 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  53.14 
 
 		 273 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  53.04 
 
 		 273 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  51.69 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 188 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  50.26 
 
 		 280 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  52.38 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  51.4 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  51.89 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  52.84 
 
 		 193 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  50 
 
 		 276 aa  185  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  52.25 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 265 aa  184  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  51.4 
 
 		 238 aa  184  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  53.45 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 175 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 175 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  49.74 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 175 aa  183  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 185 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  50.82 
 
 		 301 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.82 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  48.17 
 
 		 267 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  51.14 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>