73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0393 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  100 
 
 
388 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  55.56 
 
 
383 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  52.69 
 
 
380 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  51.34 
 
 
363 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  53.18 
 
 
383 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  51.87 
 
 
366 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  52.53 
 
 
364 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  52.01 
 
 
364 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  53.08 
 
 
367 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  52.09 
 
 
367 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  345  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  53.72 
 
 
367 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  53.08 
 
 
370 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  52.66 
 
 
369 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  50.69 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  50.27 
 
 
364 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  50.26 
 
 
368 aa  328  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  50.26 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  63.71 
 
 
257 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  48.46 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  45.77 
 
 
367 aa  298  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  42.78 
 
 
377 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  44.99 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  43.63 
 
 
357 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  43.78 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  43.63 
 
 
346 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  52.01 
 
 
384 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  62.63 
 
 
269 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  41.61 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  42.69 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  42.69 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  51.45 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  42.03 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  41.08 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  41.38 
 
 
359 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  42.73 
 
 
358 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  40.92 
 
 
360 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  39.13 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  72.02 
 
 
168 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  43.2 
 
 
361 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  37.69 
 
 
366 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 
357 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 
357 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  41.5 
 
 
364 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  38.08 
 
 
385 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  39.62 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  48.19 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  34.68 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  34.68 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  45.31 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  37.76 
 
 
369 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  34.41 
 
 
369 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  37.46 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  35.31 
 
 
336 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  35.48 
 
 
369 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  38.75 
 
 
346 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  45.31 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  43.23 
 
 
371 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  41.6 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  43.75 
 
 
389 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  43.23 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  42.19 
 
 
388 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  31.36 
 
 
161 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  31.62 
 
 
602 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  30.2 
 
 
633 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  29.37 
 
 
655 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  27.14 
 
 
625 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  26.62 
 
 
671 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>