52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0387 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  100 
 
 		 165 aa  336  9e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  43.11 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  41.76 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  42.01 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  39.66 
 
 		 175 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  43.56 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  40.23 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  40.59 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  40.24 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  38.29 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  38.12 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  37.71 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  41.42 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  40.23 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  40.12 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  37.65 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  35.8 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  35.33 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  36.46 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  35.39 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  36.05 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  36.65 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  33.53 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  32.72 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  31.07 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  32.4 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  32.4 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  31.33 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  30.82 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  31.33 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  28.24 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  31.25 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  27.78 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  29.23 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  28.25 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1990  excinuclease ABC subunit B  37.33 
 
 		 670 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.762653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  37.33 
 
 		 670 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1505  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3786  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506732  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1539  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.455329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 		 671 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  48 
 
 		 671 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2737  excinuclease ABC subunit B  46 
 
 		 671 aa  41.2  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.477744  normal  0.30638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>