196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0382 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  55.9 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  51.28 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  50.52 
 
 		 195 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  50.27 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  49.74 
 
 		 192 aa  194  7e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  51.58 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.05 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  48.68 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  50 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  47.94 
 
 		 191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  49.47 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  46.84 
 
 		 190 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  46.94 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  47.94 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  47.94 
 
 		 188 aa  177  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  47.89 
 
 		 196 aa  177  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  47.45 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  47.42 
 
 		 178 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  46.67 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  45.83 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  46.63 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  46.07 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  48.15 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  45.64 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  47.62 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  46.39 
 
 		 191 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.36 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  46.39 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  48.21 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  44.15 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  44.92 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  45.13 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  44.27 
 
 		 194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  46.67 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  42.27 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  44.27 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  43.75 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  46.63 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  42.56 
 
 		 192 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  45.03 
 
 		 191 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  44.21 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  44.85 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  43.52 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  41.97 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  40.31 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  44.15 
 
 		 179 aa  158  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  43.39 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  43.62 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  43.08 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  41.97 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.68 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  39.9 
 
 		 221 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  43.81 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  40.41 
 
 		 696 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  40.93 
 
 		 696 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.38 
 
 		 392 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  40.74 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  39.9 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  39.9 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  41.11 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  40.44 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  40.11 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  39.01 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  39.01 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  38.46 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  37.36 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  34.43 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  34.78 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  39.29 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  39.29 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  39.29 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  34.59 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  32.76 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  37.59 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  39.01 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  36.49 
 
 		 144 aa  77.8  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  38.19 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  38.19 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  34.46 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  37.86 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  36.88 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  30 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  32.04 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  36.88 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  38.13 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  39.29 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  32.26 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  33.52 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  36.17 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  36.69 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  36.69 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  37.41 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>