More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0372 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  52 
 
 
176 aa  197  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  46.55 
 
 
178 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  44.94 
 
 
194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  45.51 
 
 
194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  43.62 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  46.82 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  44.02 
 
 
186 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  42.39 
 
 
184 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  41.85 
 
 
186 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  41.85 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  42.7 
 
 
176 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  41.01 
 
 
168 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  35.03 
 
 
180 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  40.48 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  41.46 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  41.62 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  40.59 
 
 
174 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  37.08 
 
 
183 aa  110  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.33 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  40.34 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  32.99 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  35.76 
 
 
163 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  35.06 
 
 
175 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  36.78 
 
 
181 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  36.78 
 
 
181 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  37.72 
 
 
175 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  36.14 
 
 
175 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  35.76 
 
 
182 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  39.51 
 
 
192 aa  100  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  33.33 
 
 
181 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.16 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.96 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.85 
 
 
169 aa  98.6  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.99 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.05 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  35.06 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  30.62 
 
 
212 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  35.95 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.92 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.97 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.33 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  33.96 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.71 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.94 
 
 
169 aa  94.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.14 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  35.29 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.94 
 
 
278 aa  93.2  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  36.71 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  31.35 
 
 
183 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  34.08 
 
 
190 aa  92  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.97 
 
 
166 aa  92  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  34.62 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.97 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  33.92 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  36.65 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.73 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  35.15 
 
 
172 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.32 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.59 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.5 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  33.73 
 
 
170 aa  87.8  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  33.73 
 
 
169 aa  87  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  32.93 
 
 
195 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.46 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  34.34 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  26.57 
 
 
213 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.73 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  33.51 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.03 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  33.53 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.73 
 
 
191 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.25 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  32.16 
 
 
170 aa  84.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.73 
 
 
214 aa  84.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  31.64 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.4 
 
 
170 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  30 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  33.92 
 
 
321 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  36.21 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.78 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  33.33 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  31.9 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.29 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.74 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  32.57 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  32.28 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  35.12 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.37 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.36 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  30.81 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.13 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3598  hypothetical protein  33.93 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  36.72 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.65 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.81 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.95 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.1 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  32.32 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.74 
 
 
230 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>