More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0310 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  798  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.44 
 
 
384 aa  381  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  49.61 
 
 
385 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
384 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.66 
 
 
394 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  47.77 
 
 
383 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
384 aa  343  3e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  343  3e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
381 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.83 
 
 
383 aa  340  3e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.51 
 
 
380 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 
383 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.52 
 
 
391 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  41.47 
 
 
377 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.06 
 
 
382 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
378 aa  262  7e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
385 aa  254  1e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.85 
 
 
380 aa  254  1e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
378 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
378 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  37.56 
 
 
386 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
380 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
380 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
380 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
380 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
380 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 
388 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
383 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.65 
 
 
377 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
383 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.18 
 
 
380 aa  198  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  34.02 
 
 
379 aa  196  5e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  34.02 
 
 
379 aa  196  5e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  33.42 
 
 
377 aa  196  5e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.6 
 
 
377 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  32.81 
 
 
378 aa  196  8e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.58 
 
 
379 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
377 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
377 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.33 
 
 
377 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.22 
 
 
382 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
377 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
377 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.94 
 
 
383 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.02 
 
 
381 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.9 
 
 
380 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.25 
 
 
387 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2482  butyryl-CoA dehydrogenase  33 
 
 
395 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.16 
 
 
379 aa  190  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  35.14 
 
 
377 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.23 
 
 
379 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
384 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.88 
 
 
380 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 
386 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.52 
 
 
396 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  32.2 
 
 
386 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 
377 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  32.03 
 
 
378 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.73 
 
 
387 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
385 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.11 
 
 
389 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 
379 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 
380 aa  185  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.07 
 
 
380 aa  185  1e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
384 aa  185  1e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 
381 aa  185  1e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.59 
 
 
400 aa  184  2e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  34.19 
 
 
386 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.63 
 
 
381 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.25 
 
 
388 aa  183  4e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  7.52707e-06 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.63 
 
 
376 aa  183  4e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.16 
 
 
394 aa  183  5e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  32.37 
 
 
376 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29924e-10 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.37 
 
 
376 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 
386 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.65 
 
 
385 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.37 
 
 
381 aa  182  8e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.63 
 
 
376 aa  182  9e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.63 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3203  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 
381 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>