53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0256 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 333 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  61.56 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  60.32 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  58.54 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  54.22 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  55.86 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  54.28 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  54.13 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  53.64 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  51.51 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  53.01 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  53.19 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  52.11 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  50.9 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  50.3 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  50.3 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  47.27 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  34.67 
 
 		 233 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  34.93 
 
 		 244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  35.02 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.64 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.93 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  26.67 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  30.22 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  28.14 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  27 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  26.14 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  24.05 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  26.32 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.69 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  24.43 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.16 
 
 		 234 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  21.69 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.73 
 
 		 233 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  24.59 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  23.08 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.49 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  21.39 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  23.43 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.38 
 
 		 227 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.41 
 
 		 231 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.92 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.3 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.3 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.73 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.3 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.09 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  23.02 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.39 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.39 
 
 		 227 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.45 
 
 		 254 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.96 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>