More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0229 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  100 
 
 
872 aa  1803    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  43.97 
 
 
847 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  42.86 
 
 
848 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  42.68 
 
 
862 aa  635  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  41.92 
 
 
835 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  40.48 
 
 
836 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  37.56 
 
 
886 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  40.53 
 
 
838 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  36.53 
 
 
839 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.97 
 
 
835 aa  501  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  36 
 
 
810 aa  498  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.57 
 
 
783 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.55 
 
 
783 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  33.37 
 
 
783 aa  416  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  32.18 
 
 
828 aa  399  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.19 
 
 
840 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  34 
 
 
837 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  30.57 
 
 
817 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  33.45 
 
 
852 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  32.1 
 
 
877 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  33.26 
 
 
839 aa  369  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  31.66 
 
 
783 aa  365  1e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  32.18 
 
 
825 aa  365  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  34.37 
 
 
835 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  33.65 
 
 
823 aa  364  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  32.05 
 
 
832 aa  356  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  32.03 
 
 
835 aa  350  9e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  30.96 
 
 
847 aa  345  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  31.26 
 
 
873 aa  340  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.26 
 
 
841 aa  336  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  30.43 
 
 
833 aa  330  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  30.78 
 
 
767 aa  317  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  30 
 
 
826 aa  313  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  26.91 
 
 
826 aa  310  8e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  37 
 
 
822 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.48 
 
 
878 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  29.02 
 
 
834 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  33.91 
 
 
790 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  31.79 
 
 
792 aa  300  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  36.7 
 
 
792 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  30.83 
 
 
843 aa  298  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  35.95 
 
 
790 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  32.13 
 
 
805 aa  296  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  30.41 
 
 
851 aa  293  6e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  30.46 
 
 
790 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  35.27 
 
 
723 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  34.58 
 
 
818 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  37.25 
 
 
790 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  32.14 
 
 
722 aa  281  4e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.84 
 
 
411 aa  265  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  38.67 
 
 
696 aa  262  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  31.68 
 
 
716 aa  261  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  30.46 
 
 
876 aa  259  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.62 
 
 
736 aa  254  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  33.27 
 
 
622 aa  253  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.96 
 
 
419 aa  253  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  35.65 
 
 
746 aa  253  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  31.77 
 
 
621 aa  246  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  41.69 
 
 
404 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  32.12 
 
 
655 aa  246  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  37.28 
 
 
407 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  31.62 
 
 
667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  34.94 
 
 
667 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.51 
 
 
430 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.81 
 
 
411 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  32.2 
 
 
638 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  32.39 
 
 
638 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  37.8 
 
 
406 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  32.65 
 
 
638 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  32.39 
 
 
638 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  31.85 
 
 
640 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0835  peptidase U32  33.02 
 
 
638 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  32.68 
 
 
638 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  31.68 
 
 
638 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  31.14 
 
 
637 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  31.79 
 
 
654 aa  238  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  31.56 
 
 
667 aa  238  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  32.38 
 
 
635 aa  238  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  30.07 
 
 
639 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  31.53 
 
 
653 aa  237  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3797  U32 family peptidase  32.68 
 
 
638 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  30.62 
 
 
629 aa  237  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  39.62 
 
 
405 aa  237  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  31.33 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  31.25 
 
 
666 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  31.33 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  31.37 
 
 
667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  31.72 
 
 
653 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  31.37 
 
 
667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  31.37 
 
 
667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  31.73 
 
 
666 aa  236  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  34.91 
 
 
406 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  31.25 
 
 
666 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  31.96 
 
 
638 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  30.84 
 
 
644 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0847  peptidase U32  31.29 
 
 
638 aa  234  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2870  peptidase U32  30.71 
 
 
666 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.615102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  32.44 
 
 
669 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  30.46 
 
 
668 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  32.62 
 
 
652 aa  231  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>