More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0227 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  758    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  53.23 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  53.75 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  53.21 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  53.75 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  53.75 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  53.23 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  53.49 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  53.23 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  53.49 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  53.23 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  45.04 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  45.04 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  44.88 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  47.2 
 
 		 387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 387 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.27 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 416 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 416 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 427 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.46 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 421 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  30.89 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 434 aa  122  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  28.22 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  24.63 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.44 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  28.64 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.38 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  27.39 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  27.68 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 406 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.27 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  26.76 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  25.53 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  26.83 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  28.31 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.51 
 
 		 414 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  27.76 
 
 		 405 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  27.03 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  28.09 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>