More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0217 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  77.12 
 
 		 121 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  71.79 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 118 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  67.5 
 
 		 120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 119 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  157  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  63.25 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  68.7 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  63.87 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 117 aa  154  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  57.98 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  63.03 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  61.86 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11660  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  61.34 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  57.98 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  59.82 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2300  50S ribosomal protein L20  60.17 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000821818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  63.72 
 
 		 117 aa  141  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  54.62 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  70.59 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  59.66 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0494  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  56.3 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  56.3 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  57.5 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  55.46 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  59.13 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  69.61 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  59.48 
 
 		 118 aa  140  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  60.53 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  57.02 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  60.87 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  54.17 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  54.62 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  55.08 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  57.14 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  57.98 
 
 		 119 aa  137  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1884  50S ribosomal protein L20  56.67 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0962334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  62.28 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>