More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0216 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  67.69 
 
 
65 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 
64 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 
65 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  74.6 
 
 
64 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  69.23 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 
65 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 
64 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  67.19 
 
 
65 aa  84  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  63.08 
 
 
65 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  67.19 
 
 
65 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  69.35 
 
 
63 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  63.08 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  62.5 
 
 
65 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  60 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  65 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  66.67 
 
 
57 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  60.61 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  56.25 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  60 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  58.73 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  67  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 
65 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  51.56 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  60 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  63.79 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  59.38 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  54.55 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  53.85 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  59.32 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  53.23 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1382  ribosomal protein L35  67.19 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1713  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.971881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0154  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  50 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50.79 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>