More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0178 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  100 
 
 
285 aa  577  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  60.87 
 
 
288 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  57.09 
 
 
291 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  57.95 
 
 
295 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  56.16 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  55.48 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  54.8 
 
 
287 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  55.36 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  55 
 
 
290 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  55 
 
 
290 aa  319  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  55 
 
 
290 aa  319  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  55.71 
 
 
290 aa  319  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  55 
 
 
290 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  55 
 
 
290 aa  318  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  54.64 
 
 
290 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  54.64 
 
 
290 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  54.64 
 
 
290 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  54.64 
 
 
290 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  55.04 
 
 
288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  52.75 
 
 
285 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  51.25 
 
 
288 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  55.11 
 
 
296 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  52.54 
 
 
290 aa  295  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  48.01 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  46.26 
 
 
285 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  46.26 
 
 
285 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  48.18 
 
 
284 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  46.13 
 
 
280 aa  259  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  43.12 
 
 
283 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  43.17 
 
 
282 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  42.5 
 
 
282 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  41.79 
 
 
282 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  37.91 
 
 
299 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  39.08 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  44.89 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  40.88 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  40.29 
 
 
291 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  39.56 
 
 
287 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  38.04 
 
 
299 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  37.55 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  37.86 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  35.71 
 
 
294 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  37.86 
 
 
293 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  37.5 
 
 
293 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  38.75 
 
 
305 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  37.98 
 
 
291 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.93 
 
 
315 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  37.72 
 
 
319 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  38.24 
 
 
316 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  37.45 
 
 
316 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  37.45 
 
 
320 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  37.5 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  37.5 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  37.5 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  37.5 
 
 
319 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  38.85 
 
 
320 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  35.27 
 
 
306 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  36.96 
 
 
297 aa  170  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  36.9 
 
 
309 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  36.56 
 
 
318 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  34.91 
 
 
306 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  37.14 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  36.3 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  37.69 
 
 
320 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  39.71 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  37.09 
 
 
315 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  38.08 
 
 
318 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  38.06 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  39.13 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  37.99 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  37.93 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  37.02 
 
 
315 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  37.13 
 
 
320 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  36.59 
 
 
325 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.76 
 
 
310 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  37.82 
 
 
306 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  37.28 
 
 
309 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  35.51 
 
 
321 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.05 
 
 
315 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  37.93 
 
 
306 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  37.93 
 
 
306 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  36.63 
 
 
315 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  37.55 
 
 
316 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  36.92 
 
 
317 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  37.93 
 
 
306 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  37.93 
 
 
306 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  39.65 
 
 
333 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  37 
 
 
316 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  37.93 
 
 
306 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  35.93 
 
 
318 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  33.33 
 
 
319 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  38.1 
 
 
345 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  38.63 
 
 
283 aa  158  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  37.73 
 
 
369 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3104  agmatinase  39.07 
 
 
282 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  36.26 
 
 
316 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  37.01 
 
 
319 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  37.01 
 
 
319 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  37.01 
 
 
319 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  36.04 
 
 
324 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>