More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0163 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 488 aa  999    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 		 499 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  65.63 
 
 		 489 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 494 aa  638    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 510 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 493 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 494 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 499 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 491 aa  628  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 489 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 495 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 497 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 499 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 499 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 503 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 501 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  55.12 
 
 		 491 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 504 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 494 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 492 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  57.03 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 494 aa  558  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 503 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 496 aa  547  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 561 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 497 aa  541  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 501 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 508 aa  541  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.94 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.94 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 489 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 573 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 505 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 507 aa  532  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 505 aa  535  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 495 aa  531  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  53.4 
 
 		 499 aa  531  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 509 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 573 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>