More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0145 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.86 
 
 
644 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.86 
 
 
647 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.44 
 
 
608 aa  648    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.46 
 
 
614 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  55.07 
 
 
645 aa  635    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  55.39 
 
 
700 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.91 
 
 
638 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.7 
 
 
617 aa  654    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  57.19 
 
 
633 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 
660 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.65 
 
 
617 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.5 
 
 
616 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.56 
 
 
676 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  52.68 
 
 
651 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 
651 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.67 
 
 
616 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.35 
 
 
697 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.29 
 
 
671 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  56.95 
 
 
682 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.07 
 
 
638 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 
604 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  59.14 
 
 
633 aa  709    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  52.76 
 
 
647 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  54.98 
 
 
613 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.71 
 
 
599 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.63 
 
 
616 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  53.03 
 
 
641 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.54 
 
 
611 aa  746    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.4 
 
 
616 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.74 
 
 
615 aa  865    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.5 
 
 
658 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  52.8 
 
 
641 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.17 
 
 
630 aa  731    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  55.57 
 
 
616 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  55.63 
 
 
608 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  54.2 
 
 
665 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 
635 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  55.08 
 
 
617 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  54.3 
 
 
613 aa  648    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  54.08 
 
 
619 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.86 
 
 
687 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.86 
 
 
644 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  70.56 
 
 
645 aa  868    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.85 
 
 
635 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  54.85 
 
 
635 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  65.47 
 
 
753 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.97 
 
 
633 aa  705    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
610 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.25 
 
 
639 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.36 
 
 
635 aa  720    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.86 
 
 
647 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
657 aa  1340    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.25 
 
 
753 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.41 
 
 
619 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.86 
 
 
647 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.35 
 
 
697 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.86 
 
 
647 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  55.03 
 
 
637 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.07 
 
 
640 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 
634 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.58 
 
 
651 aa  643    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  55.68 
 
 
627 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 
612 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 
646 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.29 
 
 
601 aa  670    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
601 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.85 
 
 
635 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  54.37 
 
 
613 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  56.57 
 
 
602 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.39 
 
 
620 aa  819    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.65 
 
 
645 aa  636    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  53.15 
 
 
639 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 
637 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.54 
 
 
599 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  59.04 
 
 
633 aa  713    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  52.76 
 
 
647 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  51.61 
 
 
643 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.74 
 
 
614 aa  645    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  52.82 
 
 
689 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  54.75 
 
 
617 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.93 
 
 
652 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  54.92 
 
 
617 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.45 
 
 
673 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 
612 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  57.69 
 
 
654 aa  675    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.2 
 
 
621 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
610 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  61.53 
 
 
693 aa  766    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.45 
 
 
656 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.8 
 
 
641 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.95 
 
 
644 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.97 
 
 
607 aa  650    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 
656 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  57.03 
 
 
633 aa  710    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  52.76 
 
 
647 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>