More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0119 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 186 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 210 aa  186  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 		 213 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.16 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.65 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  54.6 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  47.06 
 
 		 195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  45.99 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.59 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  48.44 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  49.46 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.3 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  48.52 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.7 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 		 210 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 		 209 aa  168  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 211 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  46.45 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  47.8 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 211 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  46.75 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  44.5 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  52.76 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  44.02 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 230 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  45.03 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  46.2 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  43.98 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  42.47 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  44.92 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  43.79 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  41.08 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 		 365 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  42.35 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0591  peptidyl-tRNA hydrolase  43.96 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  43.53 
 
 		 225 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.86 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  43.16 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 192 aa  154  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0084  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  44.83 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  43.39 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  39.59 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.1 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>