More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0112 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  51.4 
 
 
727 aa  771    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  100 
 
 
727 aa  1481    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  55.33 
 
 
748 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  52.49 
 
 
734 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  54.23 
 
 
724 aa  815    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  50.62 
 
 
725 aa  769    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  46.52 
 
 
732 aa  676    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  50.97 
 
 
1675 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  46.27 
 
 
1717 aa  670    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  48.27 
 
 
715 aa  723    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 
724 aa  817    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  67.36 
 
 
721 aa  1018    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6118  ABC transporter related  46.22 
 
 
731 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  40.36 
 
 
715 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  37.11 
 
 
721 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  35.06 
 
 
731 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  34.9 
 
 
726 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  34.07 
 
 
720 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  32.36 
 
 
743 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.83 
 
 
906 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.83 
 
 
906 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.88 
 
 
908 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.46 
 
 
1019 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.24 
 
 
1042 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
1038 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  31.81 
 
 
1011 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
1038 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.62 
 
 
1040 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.82 
 
 
1018 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.22 
 
 
738 aa  336  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.37 
 
 
908 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.45 
 
 
726 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  30.81 
 
 
712 aa  334  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.46 
 
 
1018 aa  331  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  31.59 
 
 
1018 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  30.62 
 
 
725 aa  330  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.85 
 
 
1013 aa  329  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.49 
 
 
727 aa  324  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.89 
 
 
734 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.29 
 
 
717 aa  323  8e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.52 
 
 
727 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.75 
 
 
734 aa  321  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  29.84 
 
 
739 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  29.94 
 
 
704 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  29.94 
 
 
704 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  28.35 
 
 
721 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
704 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.51 
 
 
741 aa  318  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  31.43 
 
 
704 aa  317  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  30.14 
 
 
719 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  30.7 
 
 
719 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.78 
 
 
739 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  29.34 
 
 
724 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  29.39 
 
 
721 aa  311  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  27.6 
 
 
737 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.74 
 
 
760 aa  310  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  31.14 
 
 
707 aa  308  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  29.63 
 
 
918 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 
707 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  29.7 
 
 
719 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.57 
 
 
733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  28.51 
 
 
747 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  28.49 
 
 
716 aa  299  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.4 
 
 
721 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 
753 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  28.19 
 
 
772 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.05 
 
 
753 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 
753 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 
753 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 
753 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 
753 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  29.64 
 
 
722 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  29.38 
 
 
736 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.47 
 
 
770 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  31.09 
 
 
714 aa  293  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  30.55 
 
 
723 aa  292  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  29.08 
 
 
767 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.95 
 
 
1000 aa  292  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.26 
 
 
695 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  28.17 
 
 
730 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  30.56 
 
 
723 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  27.68 
 
 
723 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  27.68 
 
 
723 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.28 
 
 
683 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  27.71 
 
 
726 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  30 
 
 
721 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  29.93 
 
 
688 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  28.25 
 
 
739 aa  289  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.55 
 
 
759 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.12 
 
 
699 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.88 
 
 
720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  28.43 
 
 
719 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.71 
 
 
741 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.89 
 
 
725 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.45 
 
 
700 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1653  lantibiotic transporter containing removal activity of leader peptide  28.84 
 
 
745 aa  282  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  28.18 
 
 
722 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.47 
 
 
696 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  25.78 
 
 
725 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.53 
 
 
705 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>