More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0089 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  100 
 
 
278 aa  557  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  50.55 
 
 
274 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  50 
 
 
271 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  51.52 
 
 
282 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  51.52 
 
 
282 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  51.52 
 
 
282 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  261  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  52.34 
 
 
273 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  51.14 
 
 
282 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  46.15 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  46.3 
 
 
274 aa  251  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  47.45 
 
 
270 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  46.24 
 
 
274 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  44.81 
 
 
270 aa  241  9e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  43.8 
 
 
267 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  43.41 
 
 
267 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  46.97 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  44.94 
 
 
278 aa  236  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  42.86 
 
 
274 aa  235  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  43.22 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  43.22 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  43.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  42.97 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  45.45 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  43.51 
 
 
277 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  43.8 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  44.19 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 
197 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
195 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
197 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  28.98 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
192 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
188 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  28 
 
 
798 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
192 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
190 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
171 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 
192 aa  62.4  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
172 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  28.68 
 
 
189 aa  60.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
193 aa  60.1  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
181 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
181 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
180 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
196 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 
179 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1212  phosphoribosyltransferase  23.94 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.279163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
181 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
170 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2790  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
187 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
157 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
172 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
187 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 
190 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
181 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
185 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
172 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
172 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>