More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0078 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  66.21 
 
 
588 aa  776    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  100 
 
 
588 aa  1171    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.857462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.79 
 
 
571 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
563 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 
571 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.98 
 
 
564 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 
573 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
664 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
574 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.01 
 
 
549 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.72 
 
 
572 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
565 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
568 aa  252  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000211004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
570 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3478  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.48 
 
 
594 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  32.95 
 
 
549 aa  247  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
566 aa  243  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 
566 aa  238  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.88 
 
 
546 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.86 
 
 
571 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 
596 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
561 aa  230  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
564 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0389  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 
587 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.074674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
587 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 
566 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 
417 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 
689 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
520 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.08 
 
 
650 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  37.82 
 
 
660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  38.08 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  36.6 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  38.02 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 
573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.48 
 
 
660 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  38.02 
 
 
660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  38.02 
 
 
660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 
563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 
660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  36.6 
 
 
660 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 
572 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 
417 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  28.84 
 
 
545 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
661 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4750  chemotaxis signal transducer  31.39 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000451458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4769  methyl-accepting chemotaxis protein  31.39 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000157203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5150  chemotaxis signal transducer  31.39 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000223621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4362  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
445 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5186  methyl-accepting chemotaxis protein  34.21 
 
 
563 aa  213  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
676 aa  212  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 
695 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5185  methyl-accepting chemotaxis protein  36.29 
 
 
564 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00149704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  35.53 
 
 
660 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5194  chemotaxis signal transducer  36.56 
 
 
564 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
598 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5195  methyl-accepting chemotaxis protein  34.21 
 
 
563 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  35.54 
 
 
660 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5149  chemotaxis signal transducer  36.56 
 
 
564 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000249122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4749  chemotaxis signal transducer  36.56 
 
 
564 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  35.01 
 
 
650 aa  210  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4768  methyl-accepting chemotaxis protein  36.56 
 
 
564 aa  210  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0585277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  36.29 
 
 
564 aa  210  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0063  methyl-accepting chemotaxis protein  33.95 
 
 
563 aa  210  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000482836  normal  0.0217071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5180  methyl-accepting chemotaxis protein  36.29 
 
 
564 aa  210  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000913296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 
579 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  35.2 
 
 
660 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 
563 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  35.54 
 
 
660 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0927  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
572 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  34.47 
 
 
658 aa  209  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  35.26 
 
 
650 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  34.84 
 
 
658 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4905  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 
563 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  35.26 
 
 
650 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5280  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 
563 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5181  methyl-accepting chemotaxis protein  33.95 
 
 
563 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000942928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 
500 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4864  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
564 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 
564 aa  207  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 
541 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
580 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  34.84 
 
 
658 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
544 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1869  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.26 
 
 
607 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.68 
 
 
548 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 
660 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  33.42 
 
 
658 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1024  methyl-accepting chemotaxis protein  34.9 
 
 
575 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>