50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0073 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0073  primase/topoisomerase like protein  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000589128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1510  primase/topoisomerase like protein  42.47 
 
 
176 aa  144  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2527  primase-like protein  44.62 
 
 
182 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2841  primase-like protein  44.62 
 
 
182 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0035  primase/topoisomerase like protein  36.27 
 
 
185 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0038  primase-related protein  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0049  primase-related protein  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0039  primase-related protein  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0036  ribonuclease M5  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0036  ribonuclease M5  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000747887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0045  primase-related protein  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0038  primase-related protein  36.27 
 
 
185 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5271  primase-related protein  35.75 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0045  primase-related protein  35.75 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0036  primase/topoisomerase like protein  38.54 
 
 
187 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.278687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0035  primase/topoisomerase like protein  34.2 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0034  primase/topoisomerase like protein  36.79 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1773  ribonuclease M5  40.72 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0130  primase/topoisomerase like protein  37.43 
 
 
191 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.504524  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0212  ribonuclease M5  34.57 
 
 
188 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1781  primase-related protein  37.63 
 
 
186 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2965  primase/topoisomerase like protein  35.26 
 
 
192 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  33.51 
 
 
371 aa  104  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0130  primase-related protein  37.97 
 
 
181 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.503861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0513  hypothetical protein  35.83 
 
 
178 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.029642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0526  hypothetical protein  35.83 
 
 
178 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0178284  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1614  ribonuclease M5  36.31 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0207  ribonuclease M5  31.41 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000177928  normal  0.0149756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0717  hypothetical protein  31.72 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.740448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1550  ribonuclease M5  33.85 
 
 
184 aa  89  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0184  primase homolog  30.53 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0003  primase-related protein  26.94 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.458899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl004  nucleotidyltransferase, primase  35.09 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3082  TOPRIM domain protein  35.71 
 
 
119 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26186  predicted protein  28.1 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.347334  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0836  TOPRIM domain-containing protein  31.25 
 
 
129 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00405243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0852  TOPRIM domain-containing protein  31.18 
 
 
128 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000918877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0487  TOPRIM domain-containing protein  30.85 
 
 
128 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4812  TOPRIM domain-containing protein  32.53 
 
 
114 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3585  TOPRIM domain-containing protein  32.53 
 
 
114 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000963608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2931  TOPRIM domain protein  28.4 
 
 
116 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000218405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4715  DNA primase  31.33 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000708612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5096  Toprim domain protein  31.33 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0107  Toprim domain protein  31.33 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000016673  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4699  DNA primase  31.33 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00338236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5128  TOPRIM domain-containing protein  31.33 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5133  Toprim domain protein  31.33 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5132  Toprim domain protein  31.33 
 
 
114 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000167755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5226  TOPRIM domain-containing protein  30.12 
 
 
114 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4858  TOPRIM domain-containing protein  30.12 
 
 
114 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>