More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0067 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 650 aa  702    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 660 aa  686    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 656 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 647 aa  1333    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 660 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 632 aa  758    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 660 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 660 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 660 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 660 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 655 aa  693    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 		 653 aa  755    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 		 650 aa  699    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 660 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 647 aa  646    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 651 aa  772    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 660 aa  689    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 653 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 634 aa  662    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 657 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 660 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 660 aa  688    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 645 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 645 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 645 aa  762    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 657 aa  664    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 654 aa  761    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 648 aa  717    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 659 aa  680    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 648 aa  634  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  57.52 
 
 		 533 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 650 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  59.69 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 634 aa  617  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 645 aa  612  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 654 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 664 aa  601  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 516 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 665 aa  592  1e-168  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 638 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 508 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 651 aa  572  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 671 aa  569  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 667 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 648 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 509 aa  568  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 506 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 681 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 509 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 511 aa  555  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 663 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 642 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 628 aa  545  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 657 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 648 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 675 aa  533  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 670 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 629 aa  519  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 636 aa  521  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 632 aa  514  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 628 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 642 aa  504  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 628 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 628 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 670 aa  502  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 638 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 628 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 538 aa  463  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 530 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 722 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0176  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 528 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 526 aa  456  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 511 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>