149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0057 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  100 
 
 
523 aa  1050    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  48.37 
 
 
511 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  44.97 
 
 
523 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  45.74 
 
 
531 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  44.19 
 
 
560 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  40.85 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  42.8 
 
 
530 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  44.4 
 
 
490 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  45.51 
 
 
552 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  42.15 
 
 
541 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  43.87 
 
 
541 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  42.5 
 
 
533 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  42.86 
 
 
534 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  38.65 
 
 
520 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  41.39 
 
 
524 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  39.11 
 
 
544 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  40.78 
 
 
524 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  47.03 
 
 
587 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  41.39 
 
 
524 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  40.98 
 
 
524 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  43.92 
 
 
558 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  40.98 
 
 
524 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  41.36 
 
 
540 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  40.45 
 
 
512 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  41.58 
 
 
517 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  43.46 
 
 
517 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  39.34 
 
 
537 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  36.1 
 
 
530 aa  359  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  41.67 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  38.69 
 
 
530 aa  355  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  38.17 
 
 
478 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  38.17 
 
 
478 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  39.42 
 
 
499 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  38.17 
 
 
489 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  41.15 
 
 
500 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  38.38 
 
 
492 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  36.57 
 
 
592 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  43.46 
 
 
437 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  43.21 
 
 
437 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  43.46 
 
 
437 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  39.58 
 
 
599 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  38.9 
 
 
622 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  38.32 
 
 
589 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  38.05 
 
 
489 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  40.45 
 
 
500 aa  345  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  37.6 
 
 
519 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  37.5 
 
 
492 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  39.71 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  42.47 
 
 
500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  36.76 
 
 
633 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  38.12 
 
 
492 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  42.47 
 
 
500 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  43.05 
 
 
500 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  42.47 
 
 
500 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  43.05 
 
 
500 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  42.95 
 
 
500 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  38 
 
 
492 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  38 
 
 
492 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  37.5 
 
 
492 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  36.14 
 
 
488 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  37.5 
 
 
578 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  39.08 
 
 
596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  34.78 
 
 
511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  38.45 
 
 
515 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  41.48 
 
 
502 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  40.99 
 
 
497 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  39.05 
 
 
531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  38.12 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  38.78 
 
 
512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  38.34 
 
 
512 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  38.11 
 
 
512 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  38.7 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  38.7 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  38.91 
 
 
512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  38.91 
 
 
512 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  38.26 
 
 
512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  39.85 
 
 
496 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  37.55 
 
 
534 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  40.15 
 
 
495 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  35.02 
 
 
504 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  33.12 
 
 
504 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  34.14 
 
 
511 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  34.14 
 
 
511 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  31.63 
 
 
454 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  37.27 
 
 
503 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  30.56 
 
 
511 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  32.49 
 
 
492 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  32.39 
 
 
473 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  35.46 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  32.2 
 
 
735 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0819  spore germination protein, GerA family  39.45 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  35.93 
 
 
499 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  32.2 
 
 
747 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  32.2 
 
 
747 aa  243  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  35.87 
 
 
473 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  34.99 
 
 
499 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  35.66 
 
 
455 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  30.57 
 
 
497 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4515  spore germination protein, GerA family  38.63 
 
 
505 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  32.2 
 
 
754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>