58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0055 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  71.3 
 
 
445 aa  681    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  100 
 
 
450 aa  927    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  87.61 
 
 
447 aa  801    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  61.35 
 
 
445 aa  580  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  45.84 
 
 
437 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  44.3 
 
 
449 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  45.24 
 
 
433 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.39 
 
 
443 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  43.53 
 
 
448 aa  356  5e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.08 
 
 
443 aa  326  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  38.07 
 
 
433 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  34.15 
 
 
440 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  33.48 
 
 
437 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  32.96 
 
 
442 aa  236  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  34.15 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  33.48 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.48 
 
 
437 aa  233  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  33.26 
 
 
437 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  36.12 
 
 
435 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  36.12 
 
 
435 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  36.12 
 
 
434 aa  230  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.89 
 
 
456 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.44 
 
 
442 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  32.43 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.94 
 
 
457 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.62 
 
 
452 aa  210  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.6 
 
 
437 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  32.06 
 
 
464 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  31.4 
 
 
456 aa  186  9e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  28.54 
 
 
453 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  28.88 
 
 
455 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.4 
 
 
431 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.85 
 
 
442 aa  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  27.53 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  38.32 
 
 
210 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.94 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.18 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  24.14 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.77 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  20.3 
 
 
423 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.53 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  42.31 
 
 
115 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.67 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.24 
 
 
476 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  21.9 
 
 
406 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.68 
 
 
477 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  22.89 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  23.3 
 
 
421 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  23.42 
 
 
403 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  22.72 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  22.02 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  23.02 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  24.31 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  22.81 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.94 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  22.5 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  28.32 
 
 
269 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  26.15 
 
 
384 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>