More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0046 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 345 aa  708    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  40.82 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  35.63 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  31.69 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  31.4 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  28.41 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 378 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  25.07 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  28.25 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  28.29 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  30.7 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  30.68 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.04 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.9 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.41 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  34.64 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  32.9 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.9 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  32.9 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  32.9 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  32.48 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  28.29 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  34.21 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  27.88 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.66 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.78 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.14 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  33.12 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 		 493 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  26.23 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  32.81 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  30.24 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.86 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.86 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  29.82 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  34.87 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  36 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 		 364 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  26.44 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  26.44 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.83 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.16 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  27.39 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  30.28 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  29.77 
 
 		 408 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  33.77 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  29.7 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  36.67 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  24.62 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  31.67 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.98 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  35.14 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.81 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  24.62 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  35.86 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  28.24 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  30.82 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  30.82 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  30.82 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  28.32 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  31.77 
 
 		 460 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  24.71 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  26.17 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  24.38 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  27.4 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  27.24 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  30.82 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03750  hypothetical protein  28.06 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  31.77 
 
 		 460 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  27.42 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  33 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  30.84 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  30.69 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  30.04 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  28.03 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  32.72 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.43 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>