More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0040 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0040  histidine kinase  100 
 
 
436 aa  905    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00046406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10390  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
480 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1865  histidine kinase  29.95 
 
 
434 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  25.74 
 
 
501 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
407 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  26.55 
 
 
358 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  23.46 
 
 
486 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  26.07 
 
 
480 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.56 
 
 
468 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  26.07 
 
 
501 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  26.07 
 
 
501 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  30.04 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  25.74 
 
 
501 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  26.07 
 
 
501 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  29.6 
 
 
502 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  25.74 
 
 
501 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
331 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  25.74 
 
 
501 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  26.37 
 
 
486 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  26.89 
 
 
469 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  25.41 
 
 
501 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  25.08 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
679 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  24.67 
 
 
502 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
368 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  25.93 
 
 
360 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  25.31 
 
 
368 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  26.4 
 
 
368 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  26.4 
 
 
368 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  26.4 
 
 
368 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  26.14 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  22.8 
 
 
694 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  24.05 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  25.74 
 
 
739 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05740  signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  26.81 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  24.45 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.5 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  22.81 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  23.42 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 
488 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  24.1 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  24.75 
 
 
365 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  23.96 
 
 
352 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  26.1 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
1010 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  25.08 
 
 
291 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  23.78 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  25.82 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  22.19 
 
 
583 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  22.46 
 
 
583 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  28.51 
 
 
908 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
844 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  28.51 
 
 
897 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  28.1 
 
 
908 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  28.1 
 
 
908 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  23.31 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  22.13 
 
 
743 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  24.92 
 
 
288 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  24.71 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  24.31 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  24.71 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  24.84 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  24.92 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  23.17 
 
 
743 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  24.71 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  21.91 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
967 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2321  histidine kinase  24.66 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0637  histidine kinase  27.05 
 
 
813 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  21.8 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  21.3 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  25.26 
 
 
524 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  23.47 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  24.45 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1834  histidine kinase  27.01 
 
 
348 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  24.41 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  22.7 
 
 
491 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  25.61 
 
 
810 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  24.58 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  23.92 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  22.94 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  23.69 
 
 
1379 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  22.15 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  20.32 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>