More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0026 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  100 
 
 
331 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  46.33 
 
 
357 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  43.47 
 
 
356 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.26 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  45.32 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 
352 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  42.68 
 
 
365 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  44.2 
 
 
360 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  48.95 
 
 
356 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  44.34 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.83 
 
 
360 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  48.6 
 
 
356 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.25 
 
 
347 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
360 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  44.9 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  40.85 
 
 
359 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  41.16 
 
 
359 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  41.16 
 
 
359 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  45.15 
 
 
352 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  40.55 
 
 
359 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  40.55 
 
 
359 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  44.31 
 
 
360 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  43.48 
 
 
360 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  45.22 
 
 
360 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  41.4 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  43.35 
 
 
360 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  43.35 
 
 
360 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  43.35 
 
 
353 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  40.51 
 
 
345 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  42.59 
 
 
360 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  44.14 
 
 
360 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.55 
 
 
350 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  38.01 
 
 
344 aa  238  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  37.69 
 
 
344 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  44.27 
 
 
344 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  36.84 
 
 
354 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.19 
 
 
373 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  38.25 
 
 
354 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.53 
 
 
367 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  34.23 
 
 
355 aa  223  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  35.42 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  37.85 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.08 
 
 
355 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  34.38 
 
 
357 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  34.38 
 
 
359 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  37.85 
 
 
352 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.91 
 
 
348 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  35.67 
 
 
356 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  43.57 
 
 
350 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  36.66 
 
 
340 aa  215  8e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  35.94 
 
 
374 aa  215  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.69 
 
 
348 aa  215  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.6 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  36.27 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.38 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  37.05 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.01 
 
 
362 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.1 
 
 
336 aa  212  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  35.31 
 
 
357 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  37.46 
 
 
319 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  36.36 
 
 
349 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  32.57 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  37.66 
 
 
357 aa  198  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  34.81 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  39.49 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  36.99 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  38.87 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  43.54 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  35.64 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.83 
 
 
346 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  35.31 
 
 
361 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  32.42 
 
 
383 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  35.28 
 
 
363 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  34.48 
 
 
363 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  30.72 
 
 
359 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  33.33 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  35.26 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  33 
 
 
330 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  33.84 
 
 
362 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
366 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.54 
 
 
370 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  36.73 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  34.67 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  35.48 
 
 
346 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  35.33 
 
 
348 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.43 
 
 
345 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  35.83 
 
 
356 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 
356 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  33.54 
 
 
361 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  33.1 
 
 
347 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  32.93 
 
 
345 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  31.66 
 
 
368 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.76 
 
 
330 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33.64 
 
 
381 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  35.26 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  34.57 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.08 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  34.03 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.07 
 
 
358 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>