More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0023 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
151 aa  306  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
198 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
223 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  34.75 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.19 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.19 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  26.36 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
198 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  26 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
178 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.2 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
183 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  23.08 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  36.62 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
334 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  21.43 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
142 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
141 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  31.71 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  22.9 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>